Seal on palju kõrgkoolidele kogu Kõrgõzstani. See hõlmab ligi kolmkümmend seitse avalik-õiguslike ülikoolide ja kaheksateist eraülikoolide. Silmapaistev ülikoolide Kõrgõzstan hulka Ülikooli Kesk-Aasia ja Kirgiisi Riiklik Ülikool.

Akadeemilised asutused üle kogu maailma pakuvad BSc ehk teadusbakalaureuse kraadi. See populaarne kraad aitab tudengeid tööle astumiseks või edasiseks hariduseks ette valmistada. Keskeltläbi kulub BSc omandamiseks kolm kuni viis aastat.